83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3524 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  70.39 
 
 		 162 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  65.58 
 
 		 167 aa  220  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  71.33 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  66.45 
 
 		 167 aa  210  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  60.95 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  60.95 
 
 		 179 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  60.95 
 
 		 179 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  59.52 
 
 		 180 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  58.75 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  58.13 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  58.75 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  63.29 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  58.02 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  55.17 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  42.03 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  35.9 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  36.67 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  35.86 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  37.41 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.85 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  98.2  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  35.22 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  36.55 
 
 		 150 aa  96.7  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  37.23 
 
 		 152 aa  94.4  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.27 
 
 		 160 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.97 
 
 		 157 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.97 
 
 		 157 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  32.62 
 
 		 157 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  33.1 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.76 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.76 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.09 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  30.22 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  29.61 
 
 		 157 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  29.85 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  29.1 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 497 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.7 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1527  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.69 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000569467  decreased coverage  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1706  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.69 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0205263  normal  0.629658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1785  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.71 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.972016  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1283  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  24.63 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  34.94 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1443  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.57 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1400  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.83 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1373  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.87 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000244394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1592  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.03 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2576  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  26.92 
 
 		 446 aa  48.5  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0363046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3748  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.46 
 
 		 147 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  25.56 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0300  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.32 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0322  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.32 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0613  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  24.62 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000688375  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0071  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  33.9 
 
 		 462 aa  45.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0865  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.14 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2445  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  27.21 
 
 		 146 aa  45.1  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0415236  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0351  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.03 
 
 		 140 aa  44.7  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030563  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1697  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2122  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.14 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000719345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2956  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.47 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.744837  hitchhiker  0.000492174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1140  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.32 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252282  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2514  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  24.81 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0181011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3437  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.19 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2965  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  27.03 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0314  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.86 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1486  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  33.8 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3970  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.38 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00469939  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0236  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  25.16 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0545  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.9 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.333587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03890  hypothetical protein  21.71 
 
 		 146 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1254  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.06 
 
 		 147 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3906  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  24.82 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0293502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1986  xanthomonadin biosynthesis protein  25 
 
 		 144 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1440  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.07 
 
 		 149 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460863  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0436  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.89 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000377622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2586  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  24.65 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0174729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2625  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.14 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000137292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2120  hypothetical protein  24.81 
 
 		 132 aa  41.2  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0692944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0559  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  25.74 
 
 		 467 aa  41.2  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29800  3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  24.65 
 
 		 159 aa  41.2  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.396106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>