113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0256 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  72.4 
 
 		 194 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  70.83 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  68.65 
 
 		 190 aa  257  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  71.88 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  71.88 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  71.88 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  71.88 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  72.4 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  71.35 
 
 		 193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  71.35 
 
 		 193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  71.35 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  68.42 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  78.03 
 
 		 193 aa  232  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  69.79 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  77.91 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  59.52 
 
 		 186 aa  190  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  51.37 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  59.04 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  56.63 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  50.31 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  50.3 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  41.75 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  45.91 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  36.71 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  38.07 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  34.95 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  38.55 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  36.97 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  38.51 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  37.82 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  28 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  32.19 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  35 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  35.19 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  32.63 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  31.43 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  31.43 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  31.43 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  29.87 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  34.52 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  28.86 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  33.66 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  31.53 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  33.05 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  30.84 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  32.41 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  31.78 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  29.52 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  29.52 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  31.37 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  29.52 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  30.39 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  33.02 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  30.69 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  30.86 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  32.08 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  34.31 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  32.32 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  30.09 
 
 		 297 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  26.04 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  30.39 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  31.19 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  28.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  29.17 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  32.35 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  23.53 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>