62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  60.7 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  57 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  38.74 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  42.86 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  41.5 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  40 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  36.73 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  36.73 
 
 		 190 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  39.3 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  40.61 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  35.71 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  38.97 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  39.8 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  37.06 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  37.06 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  37.06 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  34.01 
 
 		 196 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.64 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  37.37 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  37.5 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  32.34 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  32.09 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  33.51 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  36.59 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  34.54 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  31.73 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  32.49 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  29.9 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  34.33 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  29.38 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  28.37 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  33.68 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  34.76 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  42.2 
 
 		 117 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  38.68 
 
 		 114 aa  91.3  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  29.67 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  41.28 
 
 		 119 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  41.28 
 
 		 119 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  33.33 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  32.11 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  30.32 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  33.04 
 
 		 118 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  39.18 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  26.74 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  26.74 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  26.74 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  25.4 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  45.71 
 
 		 74 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  43.86 
 
 		 72 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  41.38 
 
 		 83 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  35.82 
 
 		 75 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  36.73 
 
 		 76 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  31.43 
 
 		 77 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  37.1 
 
 		 76 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  29.17 
 
 		 75 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  40.43 
 
 		 75 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  42.11 
 
 		 72 aa  41.2  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  32.26 
 
 		 75 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>