More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19830  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  100 
 
 
285 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11740  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  68.09 
 
 
283 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2831  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.46 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.33 
 
 
262 aa  275  8e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.04 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 
468 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.72 
 
 
268 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  30.4 
 
 
256 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  26.72 
 
 
268 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.36 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.38 
 
 
253 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.06 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  29.84 
 
 
262 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  30.52 
 
 
257 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.3 
 
 
264 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  31.2 
 
 
364 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  28.85 
 
 
262 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.25 
 
 
262 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.52 
 
 
247 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1606  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.57 
 
 
249 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  31.17 
 
 
259 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.09 
 
 
326 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  32.07 
 
 
283 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  31.95 
 
 
278 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.32 
 
 
242 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.23 
 
 
259 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  27.78 
 
 
266 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
324 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.15 
 
 
368 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.87 
 
 
241 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  28.4 
 
 
261 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  28 
 
 
262 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28 
 
 
262 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.67 
 
 
259 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  27.31 
 
 
266 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.27 
 
 
263 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  31.72 
 
 
316 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.4 
 
 
258 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.72 
 
 
316 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  29.85 
 
 
275 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.47 
 
 
252 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.34 
 
 
316 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0708  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.57 
 
 
267 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5556  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.48 
 
 
274 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.34 
 
 
257 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.73 
 
 
270 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.24 
 
 
257 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  27.89 
 
 
251 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  29.17 
 
 
308 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.72 
 
 
398 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.74 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.74 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  26.59 
 
 
264 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  30.47 
 
 
265 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  30.92 
 
 
262 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
262 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.13 
 
 
256 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
262 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.69 
 
 
263 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  26.85 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  26.85 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  29.81 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.04 
 
 
321 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.59 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.51 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  29.22 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.82 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  29.92 
 
 
262 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0816  Sec-independent protein translocase TatC  29.8 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.397111  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.35 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  27.88 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  31.54 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  28.63 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.19 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  29.88 
 
 
244 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.4 
 
 
246 aa  96.3  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  30.33 
 
 
245 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  26.07 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.55 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  32.46 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.53 
 
 
253 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
314 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.64 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  30.74 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>