More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09500 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_09500  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
488 aa  997    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.084263  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13570  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
487 aa  147  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
624 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.07 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.15 
 
 
687 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 
419 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2266  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.33 
 
 
764 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.85 
 
 
666 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
571 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.57 
 
 
551 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
486 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.31 
 
 
911 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  30.85 
 
 
599 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.44 
 
 
716 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 
646 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
569 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
572 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
499 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
645 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 
332 aa  63.5  0.000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 
481 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.49 
 
 
585 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.78 
 
 
591 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
419 aa  63.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 
589 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
632 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
972 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  32.95 
 
 
643 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0065  kinase domain protein  30.7 
 
 
613 aa  62.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0464349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.29 
 
 
593 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
421 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
646 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2698  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
696 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.152894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1987  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
574 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  0.658118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
564 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  30.99 
 
 
762 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  28.03 
 
 
335 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
360 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
898 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
752 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 
774 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
503 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.45 
 
 
553 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 
773 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
335 aa  60.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
560 aa  60.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
335 aa  60.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.29 
 
 
729 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.91 
 
 
636 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
490 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 
666 aa  60.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 
1013 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.96 
 
 
898 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  23.78 
 
 
625 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.04 
 
 
916 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
947 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
642 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
480 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  29.36 
 
 
736 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
528 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2528  Serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
376 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.1 
 
 
638 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.65 
 
 
806 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 
613 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
1078 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
545 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
505 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  28.57 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  29.57 
 
 
555 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  30.43 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  27.76 
 
 
595 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.1 
 
 
587 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 
646 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 
616 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
443 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.57 
 
 
692 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.12 
 
 
747 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  28.57 
 
 
443 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.68 
 
 
618 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
443 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
547 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  28.57 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  28.37 
 
 
586 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
866 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3670  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
562 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215762  hitchhiker  0.000328552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
571 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
837 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
691 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  24.39 
 
 
614 aa  58.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
1020 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
636 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  28.57 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
680 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
596 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
777 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>