More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1987 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1987  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
574 aa  1148    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  0.658118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 
820 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  39.69 
 
 
716 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 
637 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
608 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
630 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.57 
 
 
618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  39.72 
 
 
637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  40.77 
 
 
695 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
550 aa  163  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
738 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
571 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 
743 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
528 aa  160  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 
594 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
535 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  40 
 
 
599 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
680 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  43.08 
 
 
560 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  41 
 
 
608 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 
632 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
547 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
541 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4894  serine/threonine protein kinase  40.34 
 
 
558 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 
569 aa  156  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
644 aa  156  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.55 
 
 
716 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 
564 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  36.01 
 
 
542 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  40.55 
 
 
870 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
694 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.98 
 
 
557 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  38.55 
 
 
742 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.52 
 
 
833 aa  153  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2698  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 
696 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.152894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  42.39 
 
 
589 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.11 
 
 
806 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.57 
 
 
673 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 
623 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  41.91 
 
 
604 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  40.48 
 
 
651 aa  150  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.31 
 
 
761 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
734 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.22 
 
 
641 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  40.32 
 
 
564 aa  150  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
721 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 
644 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
696 aa  150  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
292 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
870 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
421 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 
587 aa  148  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.13 
 
 
520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
590 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
624 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
569 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
613 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 
522 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  39.76 
 
 
542 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 
620 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
360 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 
646 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 
601 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4722  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
749 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
638 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
586 aa  143  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.37 
 
 
814 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0797  serine/threonine protein kinase  40.89 
 
 
587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367858  normal  0.015256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.53 
 
 
687 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 
555 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
771 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.41 
 
 
835 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
676 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  39.31 
 
 
544 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5095  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
585 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0160466  normal  0.222813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.84 
 
 
585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0921  protein kinase  40.93 
 
 
651 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0130475  normal  0.23221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8116  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.71 
 
 
654 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.34 
 
 
898 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  39.26 
 
 
481 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.7 
 
 
600 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  37.84 
 
 
837 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
612 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 
455 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.81 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.07 
 
 
865 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 
616 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2375  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 
651 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  36 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
617 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
560 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.83 
 
 
751 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
551 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
589 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>