35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0217 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  391  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  48.72 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  47.59 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  35.86 
 
 
212 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  37.89 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  40.86 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  35.48 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  29.15 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  27.41 
 
 
199 aa  112  5e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  30.1 
 
 
201 aa  111  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  36.27 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  34.38 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  34.72 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  35.92 
 
 
269 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  43.62 
 
 
225 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  34.76 
 
 
203 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  38.92 
 
 
217 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  32.12 
 
 
198 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  31.75 
 
 
199 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  38.25 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  41.89 
 
 
289 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  32.12 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  30.57 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  26.63 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  32.12 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  34.25 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  25.79 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  32.12 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  32.12 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.26 
 
 
633 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0849  hypothetical protein  29.02 
 
 
256 aa  51.6  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217146 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4805  hypothetical protein  39.13 
 
 
85 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1335  hypothetical protein  27.01 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0993069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  37.37 
 
 
266 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  30.39 
 
 
126 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>