47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3029 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  47.45 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  46.72 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  48.23 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  46.72 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  46.72 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  45.32 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  43.97 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  43.97 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  43.97 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  43.26 
 
 		 162 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  41.43 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  42.36 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  41.13 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  40.41 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  36.91 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  37.88 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  41.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  36 
 
 		 175 aa  98.6  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  39.6 
 
 		 181 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  38.13 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  37.67 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  35.97 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  32.37 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  30.66 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  31.17 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  35.66 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  29.53 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  31.78 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  29.79 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  29.33 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  29.45 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  28.37 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  28.37 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  29.5 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  28.78 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  28.77 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  27.48 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  29.73 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  30.43 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  27.34 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  28.37 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  27.21 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  25.47 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  28.03 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  26.04 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>