29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0115 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  60.08 
 
 		 253 aa  331  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  60.08 
 
 		 253 aa  331  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  59.68 
 
 		 253 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  60.08 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  58.5 
 
 		 253 aa  328  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  58.5 
 
 		 253 aa  327  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  58.5 
 
 		 253 aa  327  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  58.1 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  58.5 
 
 		 253 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  57.71 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  56.18 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  56.92 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  56.57 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  52.99 
 
 		 252 aa  299  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  48.21 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  28.92 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  29.92 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  29.63 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  28.92 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  31.45 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  30.36 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  23.39 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  27.31 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  25.9 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  24.6 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  24.8 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  25.9 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  28.11 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>