33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0006 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  100 
 
 		 323 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  89.44 
 
 		 323 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  89.44 
 
 		 323 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  90 
 
 		 323 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  63.04 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  50.31 
 
 		 321 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  31.07 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  28.98 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  32.32 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  31.13 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  27.36 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  31.17 
 
 		 382 aa  86.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  36.26 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  26.37 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  30.14 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  35.62 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  29.12 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  27.96 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  30.49 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.12 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  33.08 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  29.19 
 
 		 254 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  27.46 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  28.11 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  24.87 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  26.79 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  29.08 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  23.17 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  26.18 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  34.74 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  30.77 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>