More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2427 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2378  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  100 
 
 
336 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2535  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  100 
 
 
336 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.943275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2334  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  100 
 
 
336 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2427  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  100 
 
 
336 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2423  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  100 
 
 
336 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02077  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  97.32 
 
 
336 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2443  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  97.32 
 
 
336 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1510  Monosaccharide-transporting ATPase  97.32 
 
 
336 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.904375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2282  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  97.32 
 
 
336 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0823  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  97.32 
 
 
336 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.64113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1500  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  97.32 
 
 
336 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02036  hypothetical protein  97.32 
 
 
336 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2295  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  97.02 
 
 
336 aa  567  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575488  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3281  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  97.02 
 
 
336 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.692353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1565  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  88.69 
 
 
336 aa  541  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2748  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  96.43 
 
 
336 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.845248  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1059  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  87.5 
 
 
336 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2997  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  86.9 
 
 
336 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  80.06 
 
 
337 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2465  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  88.39 
 
 
336 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2564  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  88.39 
 
 
336 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3019  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  88.1 
 
 
336 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0195645 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.73 
 
 
342 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.73 
 
 
342 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2325  inner-membrane translocator  57.84 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  53.31 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0319  inner-membrane translocator  57.93 
 
 
362 aa  334  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  51.53 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2241  monosaccharide-transporting ATPase  46.28 
 
 
360 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
336 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2215  galactoside ABC transporter, permease protein, putative  41.21 
 
 
564 aa  212  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0821  Monosaccharide-transporting ATPase  39.77 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
331 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
341 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.14 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.01 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.01 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.06 
 
 
330 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.06 
 
 
330 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 
330 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
311 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.7 
 
 
311 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.7 
 
 
311 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 
311 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
336 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 
341 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  35.6 
 
 
341 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  36.5 
 
 
330 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  38.77 
 
 
340 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  36.5 
 
 
330 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
314 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 
330 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.62 
 
 
331 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
311 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.77 
 
 
311 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 
351 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 
334 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.73 
 
 
334 aa  175  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  39.21 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.14 
 
 
322 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.34 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1963  monosaccharide-transporting ATPase  37.69 
 
 
342 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  37.16 
 
 
341 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.27 
 
 
322 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7808  inner-membrane translocator  39.67 
 
 
344 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
334 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
346 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35.21 
 
 
346 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
341 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
334 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0055  inner-membrane translocator  39.2 
 
 
363 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
346 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.8 
 
 
348 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  36.1 
 
 
343 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.25 
 
 
310 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  36.76 
 
 
318 aa  170  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.59 
 
 
322 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.25 
 
 
310 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
326 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  36.62 
 
 
338 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
334 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.4 
 
 
345 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.65 
 
 
324 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 
835 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  37.38 
 
 
322 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.22 
 
 
350 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.94 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.55 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  36.78 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.26 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>