More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2241 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2241  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 360 aa  713    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  48.82 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  48.82 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  48.2 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  46.01 
 
 		 334 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2997  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  44.74 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1059  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  44.44 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42608  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2325  inner-membrane translocator  44.38 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  42.06 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1565  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.11 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2295  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.57 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575488  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02077  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.57 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1510  Monosaccharide-transporting ATPase  43.57 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.904375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02036  hypothetical protein  43.57 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2443  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.57 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0823  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.57 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.64113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2282  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.57 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1500  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.57 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2378  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.86 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2334  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.86 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2423  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.86 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2427  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.86 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2535  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.86 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.943275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3281  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.57 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.692353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2564  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  45 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2465  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  45 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2215  galactoside ABC transporter, permease protein, putative  40.42 
 
 		 564 aa  223  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0319  inner-membrane translocator  44.65 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3019  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  45 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0195645 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0821  Monosaccharide-transporting ATPase  38.63 
 
 		 551 aa  219  6e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2748  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.86 
 
 		 336 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.845248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.01 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.72 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.01 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.72 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.01 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.24 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.27 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  32.2 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.37 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  33.75 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  30.88 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1963  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.46 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  32.46 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.06 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.13 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.06 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  35.78 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30.21 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  32.46 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  30.9 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.68 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  31.58 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.91 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.21 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  35.44 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  36.63 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  34.04 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  34.04 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 334 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  32 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  33.68 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>