183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2844 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2844  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2499  DJ-1/PfpI family protein  75.36 
 
 		 214 aa  329  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  37.77 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  33.62 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  35.71 
 
 		 227 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  35.53 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  35.53 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  35.53 
 
 		 227 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  35.05 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  34.54 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  35.64 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  32.16 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.16 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.15 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.61 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  31.25 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.03 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.31 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  29.74 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.76 
 
 		 227 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  30.47 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  29.57 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  31.3 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  35 
 
 		 166 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  32.9 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  32.8 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  29.29 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.96 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  31.3 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  32 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  31.79 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  30.77 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  33.16 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.75 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  28.88 
 
 		 228 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  27.71 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  26.04 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  32.17 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  32.52 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  28.93 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  30.4 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  28.63 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2722  putative intracellular protease/amidase-like protein  30.17 
 
 		 378 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268961  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  29.38 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.44 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.24 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  29.29 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0621  ThiJ/PfpI domain protein  26.8 
 
 		 376 aa  92.4  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  28 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  28.91 
 
 		 220 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  32.34 
 
 		 230 aa  92.4  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  27.9 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  28.91 
 
 		 220 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  27.56 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  28.44 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  27.51 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.39 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  27.27 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.77 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.51 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.38 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.29 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  28.44 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  29.13 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  28.76 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.79 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  27.85 
 
 		 224 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.59 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.49 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.49 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  28 
 
 		 229 aa  85.9  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.78 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  31.28 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  28.57 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  29.17 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.61 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.06 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  27.43 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.76 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  29.06 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.11 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.45 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  29.49 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  27.54 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  30.57 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  29.63 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1296  putative intracellular protease/amidase  33.33 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  26.29 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  25.65 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  30.64 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.46 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  26.15 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.11 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  28.22 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  27.78 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.97 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  29.23 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.27 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  30.05 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.24 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>