208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2442 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  473  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  80.53 
 
 		 228 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  79.65 
 
 		 228 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  78.32 
 
 		 228 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  61.43 
 
 		 227 aa  299  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  61.33 
 
 		 229 aa  299  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  61.43 
 
 		 227 aa  298  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  61.43 
 
 		 227 aa  298  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  61.33 
 
 		 229 aa  298  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  60.44 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  59.56 
 
 		 227 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  46.4 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  48.2 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.47 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  44.25 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  42.49 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.26 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  45.61 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  45.73 
 
 		 250 aa  201  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.06 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  45.37 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  54.27 
 
 		 166 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  44.93 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  44.3 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  44.3 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  42.98 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  43.42 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.42 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  45.18 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  41.96 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.37 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  43.17 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  42.48 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  40.35 
 
 		 227 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  38.12 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.15 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  41.78 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  39.66 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  42.34 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.18 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  44.84 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.48 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.48 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  39.46 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  41.78 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  41.59 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.16 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  40.62 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.16 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  38.16 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  40 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  41.85 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  38.57 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.72 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.05 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  36.44 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  38.84 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  40.38 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1296  putative intracellular protease/amidase  40.8 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.62 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.68 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.44 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  36.61 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.11 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  36.61 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  39.29 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  37.61 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  38.5 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  38.67 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  37.61 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  40.44 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  38.84 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  36.77 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  39.71 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.44 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.89 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  39.71 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  36.61 
 
 		 357 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  37.17 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.11 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  36.24 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.56 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  37.5 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  37.22 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  37.28 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  36.61 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.77 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>