More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0888 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  100 
 
 		 419 aa  869    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  75.6 
 
 		 404 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  69.23 
 
 		 405 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  69.16 
 
 		 412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  68.03 
 
 		 405 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  67.79 
 
 		 405 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  69.78 
 
 		 403 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  60.86 
 
 		 409 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  58.51 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  57.63 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  56.46 
 
 		 405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  56.83 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  57.74 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  53.49 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  52.87 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  46.88 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  45.78 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  45.78 
 
 		 400 aa  346  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  43.28 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  42.46 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  40.2 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  40 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  40.51 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  41.31 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  41.35 
 
 		 380 aa  315  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  37.81 
 
 		 453 aa  315  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  38.1 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  38.65 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  33.42 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  33.42 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  28.8 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  32.9 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  33.42 
 
 		 380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  29.71 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.52 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.52 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  28.99 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.52 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.52 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.52 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29.52 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29.26 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  30.62 
 
 		 359 aa  160  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.26 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  33.15 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  30.93 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  28.8 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  30.71 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  28.99 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  32.72 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  29.41 
 
 		 371 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  28.01 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  29.22 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  32.99 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  31.59 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  32.45 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  34.16 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  27.35 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  27.35 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  27.32 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  29.26 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  29.26 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  29.07 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  30.55 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  28.61 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.43 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  29.19 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  29.19 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.61 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  33.99 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.77 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  29.27 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  32.62 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  31.96 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  32.43 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  36.12 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  27.03 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  35.92 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  32.89 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  26.84 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  31.42 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.08 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  27.48 
 
 		 373 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  32.95 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  27.49 
 
 		 352 aa  137  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  31.03 
 
 		 353 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  27.64 
 
 		 323 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  31.42 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  30.65 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  31.03 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  31.03 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  31.03 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.03 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  31.03 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.7 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  30.05 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  30.65 
 
 		 353 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  31.6 
 
 		 353 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  31.4 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  29.35 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>