55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0846 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0846  amidohydrolase  100 
 
 		 460 aa  946    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  22.66 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.11 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  24.44 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  23.36 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  22.3 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  24.94 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.22 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  23.26 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  32.5 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  24.22 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  23.97 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  21.21 
 
 		 490 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  21.67 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  22.69 
 
 		 568 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  22.95 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  32.12 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  19.22 
 
 		 1084 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  21.7 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  26.39 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  29.01 
 
 		 361 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  30.53 
 
 		 485 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  22.38 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  23.36 
 
 		 381 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.87 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  23.3 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  21.57 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.7 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.52 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  22.17 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  24.16 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.31 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  23.18 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  24.12 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.66 
 
 		 1138 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  23.72 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  27.37 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  25.5 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  23.92 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  21.33 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  22.46 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  24.23 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25.28 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  20.5 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  31.48 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  23.74 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  23.89 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  23.89 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  20.98 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  40.35 
 
 		 469 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  20.94 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  27.71 
 
 		 411 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  31.06 
 
 		 496 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  22.3 
 
 		 686 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>