More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2158 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  44.33 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  43.57 
 
 		 285 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  45.93 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  46.75 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  46.34 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  45.49 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  44.72 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  45.49 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  44.58 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  44.58 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  41.77 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  40.08 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  40.38 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  35.9 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  40.76 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  44.49 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  40.08 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  39.83 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.35 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  30.91 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  33.45 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  36.95 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  33.1 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  37.34 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  37.56 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  38.31 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  37.65 
 
 		 267 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  37.08 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 258 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.42 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  34.08 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  36.99 
 
 		 244 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  32.62 
 
 		 246 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  35.91 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 236 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  32.61 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  30.21 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.89 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  32.17 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  32.17 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  34.76 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  32.91 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  32.9 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3422  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402253  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  32.9 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  32.9 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  30 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31.88 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 		 245 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  33.8 
 
 		 223 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 223 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  33.97 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  29.28 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.68 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0386  OmpA/MotB  32.16 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.28 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  30.55 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  29.26 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.08 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  26.69 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  35.32 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  29.39 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  32.27 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  31.88 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  38.31 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  28.74 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  31.16 
 
 		 229 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  35.21 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  31.03 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  28.79 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  30.26 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  31.67 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  28.35 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  26.74 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  33.18 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>