More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0578 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  100 
 
 
167 aa  350  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  56.95 
 
 
152 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  51.66 
 
 
151 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  51.66 
 
 
151 aa  168  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  51.66 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  49.67 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  51.66 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  51.66 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
151 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
158 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
155 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
151 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
151 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  50.99 
 
 
151 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597954  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  48.34 
 
 
151 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  48.34 
 
 
153 aa  154  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 
152 aa  153  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 
151 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 
156 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  46.36 
 
 
151 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  42.38 
 
 
152 aa  140  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 
155 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  44.08 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  40.4 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  43.79 
 
 
153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  40.52 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
154 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
153 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  42.38 
 
 
160 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
162 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  42.21 
 
 
156 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  42.21 
 
 
156 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  44.74 
 
 
157 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
177 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  51.65 
 
 
99 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  34.44 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
156 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  38.02 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4877  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667695  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  33.77 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
128 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4326  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5274  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  31.91 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.63 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  25.81 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
149 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 
167 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
159 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
159 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  35.23 
 
 
299 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
167 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  30.63 
 
 
312 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0904  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
148 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0974186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
320 aa  51.2  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0987  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
131 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35 
 
 
299 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.457059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>