31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0325 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 451 aa  929    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  57.62 
 
 		 502 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  43.91 
 
 		 621 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  29.13 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 814 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  29.52 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  33.93 
 
 		 593 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  33.75 
 
 		 681 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  28 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  31.13 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  30.41 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  28.37 
 
 		 743 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  30.95 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  27.14 
 
 		 572 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  30.97 
 
 		 572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  28.85 
 
 		 566 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  27.43 
 
 		 584 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  26.4 
 
 		 900 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  25.48 
 
 		 335 aa  90.1  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 343 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  30.35 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.59 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  27.99 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  25.56 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  24.24 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  22.74 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  25.13 
 
 		 869 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  23.23 
 
 		 1194 aa  43.9  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  23.97 
 
 		 349 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>