52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1703 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  47.43 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  47.16 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  44.63 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  40.88 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  38.82 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  39.05 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  38.6 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  38.37 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  37.5 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  35.71 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  37.28 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  36.26 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  36.9 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  32.57 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  35.33 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  31.68 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  31.14 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  29.89 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  28.81 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  29.07 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  30.3 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  28.74 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  29.17 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  27.91 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  26.44 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  32.37 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  32.94 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  33.33 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  30.32 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  25.95 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  23.17 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  24.24 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  25.32 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  26.9 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  25.47 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  26.99 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  22.75 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  27.33 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4197  DinB family protein  33.9 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  23.57 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  25.33 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  24.38 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  25.49 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  21.51 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  20.93 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  20.93 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  22.29 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1093  DinB family protein  28.14 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.389031  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  21.6 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>