More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1474 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4030  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.51 
 
 		 955 aa  853    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00685  alpha-ketoglutarate decarboxylase  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4190  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  39.79 
 
 		 920 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3607  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.21 
 
 		 1006 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0522268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01875  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.06 
 
 		 939 aa  655    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0131878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3100  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.72 
 
 		 935 aa  646    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0986  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  82.98 
 
 		 934 aa  1639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0227643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1952  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.43 
 
 		 937 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00674  hypothetical protein  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3723  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.2 
 
 		 941 aa  798    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.905806  hitchhiker  0.000245924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0079  alpha-ketoglutarate decarboxylase  38.01 
 
 		 948 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1380  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.4 
 
 		 955 aa  857    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2144  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  45.11 
 
 		 941 aa  823    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09540  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.77 
 
 		 1283 aa  643    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0830  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.19 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2883  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.66 
 
 		 987 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.684805  normal  0.693024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1177  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.57 
 
 		 955 aa  857    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1158  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.4 
 
 		 955 aa  856    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1152  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.4 
 
 		 955 aa  856    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4170  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.14 
 
 		 1294 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1144  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.43 
 
 		 935 aa  646    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.448629  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2625  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.77 
 
 		 987 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.835957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0231  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.69 
 
 		 987 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3493  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.94 
 
 		 959 aa  646    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3396  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.72 
 
 		 951 aa  775    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177532  normal  0.434505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0566  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.15 
 
 		 1214 aa  653    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.622687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2881  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.25 
 
 		 935 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0255  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.63 
 
 		 912 aa  643    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0124838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1796  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.94 
 
 		 950 aa  918    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29770  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.24 
 
 		 943 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1418  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.4 
 
 		 955 aa  858    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.65 
 
 		 940 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1314  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.51 
 
 		 955 aa  857    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.303839  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0965  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.89 
 
 		 992 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3681  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.64 
 
 		 1219 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0333  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  43.99 
 
 		 945 aa  788    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1340  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.4 
 
 		 955 aa  857    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2251799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1623  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  38.13 
 
 		 949 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1270  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.57 
 
 		 955 aa  857    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0892  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.19 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.349093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1213  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.86 
 
 		 987 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2914  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.52 
 
 		 935 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.19 
 
 		 955 aa  855    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1532  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.78 
 
 		 953 aa  769    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00682538  normal  0.0204532 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.19 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0273322  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19420  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.73 
 
 		 1317 aa  657    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.673379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0831  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.84 
 
 		 985 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.270147 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01355  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.9 
 
 		 941 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1806  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.42 
 
 		 1258 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0773  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0829  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.67 
 
 		 940 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.196353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1236  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.8 
 
 		 935 aa  646    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.824497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2183  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.23 
 
 		 940 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1267  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.78 
 
 		 937 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209751  normal  0.0974265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1217  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.99 
 
 		 943 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.718447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0542  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.29 
 
 		 989 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1503  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 932 aa  1934    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0798484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0818  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0738  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.81 
 
 		 933 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0846  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.52 
 
 		 938 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0961  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.18 
 
 		 958 aa  883    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2370  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.9 
 
 		 1220 aa  711    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.604296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0919  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.04 
 
 		 952 aa  930    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1154  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.56 
 
 		 945 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2535  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.06 
 
 		 946 aa  767    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00287256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1799  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.46 
 
 		 940 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243197  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.19 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3398  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.48 
 
 		 994 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2013  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.57 
 
 		 952 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.430973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1454  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.47 
 
 		 1083 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2487  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  40.85 
 
 		 1267 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0645  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.81 
 
 		 933 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1042  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  44.27 
 
 		 1425 aa  720    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2609  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.99 
 
 		 941 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1377  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.68 
 
 		 943 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0156  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.07 
 
 		 984 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4122  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.56 
 
 		 998 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.61 
 
 		 943 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1219  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.25 
 
 		 1250 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.56639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2171  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.03 
 
 		 958 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0853534  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07730  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.79 
 
 		 1236 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0739181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.88 
 
 		 942 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2941  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.65 
 
 		 998 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1384  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.25 
 
 		 935 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.761242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3675  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  40.92 
 
 		 1229 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2800  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  39.31 
 
 		 945 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0795  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.08 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0976096  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1474  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 932 aa  1934    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2968  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.25 
 
 		 935 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1226  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.95 
 
 		 935 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.234202 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.5 
 
 		 954 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2047  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  36.99 
 
 		 950 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.738586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1180  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.2 
 
 		 950 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1000  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.5 
 
 		 954 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0848692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3689  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.51 
 
 		 938 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0077  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.44 
 
 		 987 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0119842  normal  0.790423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.73 
 
 		 920 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.18577  normal  0.0679634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>