More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1042 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05571  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) (Eurofung)  39.49 
 
 
1048 aa  637    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.532364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00685  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.74 
 
 
933 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.74 
 
 
933 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2625  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.51 
 
 
987 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.835957  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2449  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.56 
 
 
894 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4189  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.08 
 
 
943 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0986  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.96 
 
 
934 aa  739    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0227643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1952  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.1 
 
 
937 aa  681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1309  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.34 
 
 
884 aa  641    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1269  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.84 
 
 
953 aa  682    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2503  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.05 
 
 
943 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858572  normal  0.126982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1380  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.8 
 
 
955 aa  815    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2219  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.81 
 
 
934 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1923  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.82 
 
 
1004 aa  685    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.06 
 
 
939 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2199  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  43.21 
 
 
943 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1177  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.64 
 
 
955 aa  813    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1158  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.58 
 
 
955 aa  813    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1152  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.58 
 
 
955 aa  812    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1052  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.71 
 
 
954 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0597  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43 
 
 
936 aa  669    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0578  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.84 
 
 
936 aa  668    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1772  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.71 
 
 
954 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2009  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.21 
 
 
943 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.9 
 
 
945 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256736  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0566  alpha-ketoglutarate decarboxylase  45.61 
 
 
1214 aa  920    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.622687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.71 
 
 
954 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2047  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.04 
 
 
950 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.738586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4481  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.09 
 
 
944 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0255  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.38 
 
 
912 aa  680    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2218  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.35 
 
 
1283 aa  851    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0422  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.37 
 
 
985 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1924  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.71 
 
 
954 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.97 
 
 
940 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1614  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.42 
 
 
943 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3492  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2013  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.45 
 
 
952 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.430973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0965  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.51 
 
 
992 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2940  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.02 
 
 
907 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000647014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4649  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.24 
 
 
954 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.355037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.23 
 
 
896 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1270  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.64 
 
 
955 aa  813    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2515  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.65 
 
 
943 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1213  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.81 
 
 
987 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2556  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.59 
 
 
954 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0781  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.12 
 
 
939 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0981915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3748  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.95 
 
 
1244 aa  860    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0278  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.38 
 
 
985 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1180  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.54 
 
 
950 aa  670    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0077  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.78 
 
 
987 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0119842  normal  0.790423 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0832  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.95 
 
 
912 aa  674    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3690  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.72 
 
 
1270 aa  833    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222337  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3987  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.4 
 
 
1264 aa  880    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439029  normal  0.370702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2321  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.99 
 
 
963 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.676675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2106  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.05 
 
 
953 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000654804  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0191  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.28 
 
 
991 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49109  predicted protein  40.97 
 
 
994 aa  658    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.808055  normal  0.27646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2812  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.89 
 
 
953 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.198639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2183  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.88 
 
 
940 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0544  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.05 
 
 
985 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.898698  normal  0.505126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1217  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.52 
 
 
943 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.718447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0542  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.39 
 
 
989 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.18 
 
 
961 aa  644    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2050  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.81 
 
 
950 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414377  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1750  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.71 
 
 
954 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1655  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.44 
 
 
940 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338838  normal  0.90286 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0840  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.34 
 
 
951 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3248  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.63 
 
 
959 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3511  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.37 
 
 
983 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364999  normal  0.890777 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1226  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40 
 
 
935 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.234202 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1028  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.12 
 
 
954 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3973  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.4 
 
 
1269 aa  880    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2535  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  53.33 
 
 
946 aa  866    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00287256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1799  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.98 
 
 
940 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1154  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.23 
 
 
945 aa  701    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3398  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.57 
 
 
994 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0025  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.05 
 
 
999 aa  672    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3362  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.91 
 
 
946 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.044527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2269  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.12 
 
 
939 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.666727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1635  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.6 
 
 
939 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1710  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.6 
 
 
939 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.799991  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2609  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.22 
 
 
941 aa  679    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2343  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.39 
 
 
940 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0982455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1498  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.71 
 
 
954 aa  685    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2817  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.61 
 
 
994 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.900682  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1390  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.12 
 
 
954 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.65 
 
 
943 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2645  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.6 
 
 
1277 aa  858    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1508  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.12 
 
 
954 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3547  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.45 
 
 
901 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2395  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.31 
 
 
981 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0106518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1710  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.67 
 
 
939 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.150842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4477  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.81 
 
 
1262 aa  838    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.655001  normal  0.23332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0586  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.79 
 
 
1233 aa  846    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.577894  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1822  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.46 
 
 
958 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.549181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0555  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.39 
 
 
988 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0848498  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1737  alpha-ketoglutarate decarboxylase  44.18 
 
 
1263 aa  886    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.765927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1000  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.71 
 
 
954 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0848692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4047  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.4 
 
 
1269 aa  880    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2252  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  40.02 
 
 
935 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.392494  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1086  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.77 
 
 
945 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>