More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0986 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1000  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 954 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0848692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00685  alpha-ketoglutarate decarboxylase  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1750  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 954 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2013  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.09 
 
 		 952 aa  656    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.430973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1796  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.38 
 
 		 950 aa  899    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1430  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.61 
 
 		 954 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0986  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 934 aa  1934    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0227643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1952  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.6 
 
 		 937 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3493  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.24 
 
 		 959 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1532  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.45 
 
 		 953 aa  759    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00682538  normal  0.0204532 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1852  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.96 
 
 		 1004 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1380  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.46 
 
 		 955 aa  825    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2219  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.28 
 
 		 934 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67632  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 954 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.673869  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1923  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.07 
 
 		 1004 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1806  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.2 
 
 		 1258 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2630  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.9 
 
 		 943 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1177  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.46 
 
 		 955 aa  825    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1158  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.46 
 
 		 955 aa  824    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1152  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.46 
 
 		 955 aa  825    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0961  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.5 
 
 		 958 aa  851    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1052  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 954 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0773  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01198  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.81 
 
 		 942 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4030  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.35 
 
 		 955 aa  823    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4170  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.26 
 
 		 1294 aa  663    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1655  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.91 
 
 		 940 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338838  normal  0.90286 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1418  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.56 
 
 		 955 aa  827    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1236  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.89 
 
 		 935 aa  646    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.824497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2884  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.75 
 
 		 950 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.554581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4190  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  38.49 
 
 		 920 aa  641    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0255  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.89 
 
 		 912 aa  637    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1226  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.45 
 
 		 935 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.234202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19420  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.49 
 
 		 1317 aa  651    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.673379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1924  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 954 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.29 
 
 		 940 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1614  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.96 
 
 		 943 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3492  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2370  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.92 
 
 		 1220 aa  684    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.604296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.35 
 
 		 955 aa  824    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4649  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.81 
 
 		 954 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.355037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0156  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.73 
 
 		 984 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1270  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.46 
 
 		 955 aa  825    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3607  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.31 
 
 		 1006 aa  642    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0522268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1213  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.98 
 
 		 987 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0333  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  43.56 
 
 		 945 aa  771    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01355  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.02 
 
 		 941 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0892  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.85 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.349093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1042  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.96 
 
 		 1425 aa  719    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1267  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.76 
 
 		 937 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209751  normal  0.0974265 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1772  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 954 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01875  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.43 
 
 		 939 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0131878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2914  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.26 
 
 		 935 aa  643    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1788  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.16 
 
 		 940 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0645  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.07 
 
 		 933 aa  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2883  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.59 
 
 		 987 aa  644    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.684805  normal  0.693024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1640  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.68 
 
 		 953 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337584  normal  0.0829235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2812  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.47 
 
 		 953 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.198639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00674  hypothetical protein  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2183  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.54 
 
 		 940 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0818  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1217  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.75 
 
 		 943 aa  666    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.718447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1144  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.34 
 
 		 935 aa  646    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.448629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0829  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.06 
 
 		 940 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.196353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0738  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004112  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.61 
 
 		 941 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1314  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.46 
 
 		 955 aa  825    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.303839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3723  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.21 
 
 		 941 aa  773    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.905806  hitchhiker  0.000245924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1028  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.74 
 
 		 954 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0795  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.85 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0976096  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2144  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  43.92 
 
 		 941 aa  808    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0830  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.85 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2535  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.53 
 
 		 946 aa  764    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00287256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1799  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.91 
 
 		 940 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1377  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.68 
 
 		 943 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3398  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.48 
 
 		 994 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2881  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.15 
 
 		 935 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1454  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.76 
 
 		 1083 aa  643    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1340  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.46 
 
 		 955 aa  824    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2251799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3100  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.19 
 
 		 935 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2171  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.5 
 
 		 958 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0853534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2609  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.91 
 
 		 941 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0919  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.32 
 
 		 952 aa  922    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1390  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.54 
 
 		 954 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.85 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0273322  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2968  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.15 
 
 		 935 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1508  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.74 
 
 		 954 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3396  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.93 
 
 		 951 aa  766    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177532  normal  0.434505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.85 
 
 		 933 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1710  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.75 
 
 		 939 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150842 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1474  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  82.98 
 
 		 932 aa  1639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1498  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.31 
 
 		 954 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0933  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.65 
 
 		 1001 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1384  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.15 
 
 		 935 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.761242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0079  alpha-ketoglutarate decarboxylase  37.8 
 
 		 948 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1484  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.74 
 
 		 954 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1260  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.78 
 
 		 898 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.07 
 
 		 933 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1503  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  82.98 
 
 		 932 aa  1639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0798484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>