More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3639 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  754    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  66.67 
 
 
373 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 
346 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.46 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
378 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  25.53 
 
 
371 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
359 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.97 
 
 
386 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  31.3 
 
 
360 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
379 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
399 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 
382 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
390 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  33.98 
 
 
390 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4781  oxidoreductase domain-containing protein  34.24 
 
 
317 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4400  oxidoreductase-like protein  34.24 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.79 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4487  oxidoreductase domain-containing protein  34.24 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.95 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
396 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
386 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
384 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
373 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.51 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.13 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.46 
 
 
382 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  25.26 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.32 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  36.62 
 
 
371 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
384 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  27.69 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.69 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 
396 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 
369 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  33.98 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  22.72 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.04 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  31.46 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  25.87 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.53 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  26.51 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  29.49 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  30.24 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  33.53 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25.25 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>