More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4487 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4400  oxidoreductase-like protein  100 
 
 
317 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4487  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4781  oxidoreductase domain-containing protein  99.68 
 
 
317 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 
373 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 
379 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
346 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
375 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  34.24 
 
 
373 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
366 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.72 
 
 
377 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3402  oxidoreductase, putative  24.49 
 
 
338 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
360 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07261  hypothetical protein  24.49 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  31.41 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  23.12 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.41 
 
 
369 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  29.47 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  31.94 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.81 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  24.36 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
665 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  22.03 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.75 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  21.81 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  28.95 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
371 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  20.68 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  22.1 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  33.82 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  20.17 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  24.73 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  26.37 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  23.97 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  28.91 
 
 
474 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 
377 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.26 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 
354 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
351 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
367 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  34.42 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 
362 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
665 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.15 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  20.55 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.01 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.15 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 
384 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  22.01 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  22.01 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  34.35 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  26.85 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  24.26 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
366 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
382 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>