31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2715 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  100 
 
 		 182 aa  363  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  51.88 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  36.84 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  44.59 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  44.3 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  43.87 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  43.87 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  47.13 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  53.85 
 
 		 336 aa  98.2  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  39.29 
 
 		 210 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  52.5 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  45.78 
 
 		 233 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  35.66 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  48.1 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  32.14 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  32.05 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  59.18 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  47.3 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  55.17 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  55.17 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  43.9 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  48.39 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  40.54 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  27.98 
 
 		 256 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  29.07 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  29.07 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  34.65 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  28.49 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  35.71 
 
 		 338 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  28 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  28 
 
 		 129 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>