More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3052 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
524 aa  1060    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3499  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  55.36 
 
 
524 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  51.18 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  49.22 
 
 
517 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  46.73 
 
 
521 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  41.12 
 
 
550 aa  349  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 
514 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  43.12 
 
 
507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  37.32 
 
 
541 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0131  amino acid adenylation domain-containing protein  36.72 
 
 
540 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  35.4 
 
 
535 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  34.38 
 
 
983 aa  236  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  34.57 
 
 
1528 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
539 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  37.91 
 
 
1074 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  34.73 
 
 
597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  34.67 
 
 
2625 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  34.56 
 
 
1990 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.31 
 
 
1336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  32.64 
 
 
556 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  33.66 
 
 
2154 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  34.85 
 
 
4383 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.7 
 
 
2033 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.16 
 
 
1550 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  31.52 
 
 
2054 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.7 
 
 
2151 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  33.86 
 
 
1553 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  36.07 
 
 
2651 aa  209  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.96 
 
 
2791 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  31.52 
 
 
1518 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  30.99 
 
 
3374 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.74 
 
 
1556 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  32.69 
 
 
1383 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  29.75 
 
 
1533 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  31.52 
 
 
1518 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.4 
 
 
1833 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  34.69 
 
 
2419 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  33.33 
 
 
1801 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  30.55 
 
 
1556 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  31.74 
 
 
1643 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  34.47 
 
 
2151 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.95 
 
 
2666 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  33.27 
 
 
5328 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  32.75 
 
 
1816 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.33 
 
 
5738 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.59 
 
 
8646 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  34.93 
 
 
2439 aa  203  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 
1405 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.27 
 
 
13537 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  35.07 
 
 
1769 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.63 
 
 
1344 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  29.83 
 
 
2164 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0965  amino acid adenylation domain protein  30.64 
 
 
1506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  30.63 
 
 
2345 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  29.79 
 
 
627 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3493  hypothetical protein  30.75 
 
 
523 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0647541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  31.16 
 
 
534 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  30.63 
 
 
2336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.66 
 
 
4318 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  31.73 
 
 
7168 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  30.43 
 
 
2338 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  35.34 
 
 
2201 aa  200  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  33.01 
 
 
3165 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.24 
 
 
2156 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  31.02 
 
 
1142 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  30.56 
 
 
2031 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  30.35 
 
 
1518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  29.56 
 
 
1533 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  29.48 
 
 
1331 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.15 
 
 
5469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  33.27 
 
 
4265 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  33.27 
 
 
4265 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.27 
 
 
4239 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.96 
 
 
3208 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.17 
 
 
6403 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.55 
 
 
2156 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  31.91 
 
 
1470 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.52 
 
 
3404 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  31.91 
 
 
1470 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2106  amino acid adenylation domain-containing protein  34.38 
 
 
1927 aa  196  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.55 
 
 
2156 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.46 
 
 
6176 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  31.3 
 
 
1525 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.74 
 
 
4968 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  35.52 
 
 
1317 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.78 
 
 
5372 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  29.38 
 
 
888 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  34.08 
 
 
1344 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  31.15 
 
 
2752 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  32.82 
 
 
3168 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 
545 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143385  decreased coverage  0.00095166 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.08 
 
 
3133 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  31.29 
 
 
3291 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  30.12 
 
 
1093 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  35.81 
 
 
1304 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  30.29 
 
 
6202 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.88 
 
 
3498 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.08 
 
 
3127 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.14 
 
 
2370 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>