32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1577 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  50.68 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  48.58 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  48.74 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 407 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06550  conserved hypothetical protein  38.62 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0982695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  48.19 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  28.82 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  36.76 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  36.11 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  32.12 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  38.1 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  38.1 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  21.4 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  35.92 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  35.48 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  31.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  25.9 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  34.48 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  38.2 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  38.27 
 
 		 323 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  38.03 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  34.12 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  32 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  27.27 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  32.89 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  32.94 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  27.38 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>