59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0261 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  85.31 
 
 
249 aa  340  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  46.12 
 
 
228 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  43.78 
 
 
215 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  53.85 
 
 
212 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  44.23 
 
 
219 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  52.2 
 
 
211 aa  184  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  46.08 
 
 
220 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  43.78 
 
 
202 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  47.93 
 
 
211 aa  168  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  48.52 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  40.98 
 
 
226 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  44.91 
 
 
220 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  46.02 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  43.93 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  37.27 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  35.43 
 
 
247 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  35.35 
 
 
273 aa  108  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  35.71 
 
 
240 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  36.71 
 
 
197 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  35.03 
 
 
239 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  34.03 
 
 
382 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  33.65 
 
 
211 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  34.16 
 
 
250 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  40.74 
 
 
256 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  37.37 
 
 
303 aa  101  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  36.36 
 
 
239 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  33.87 
 
 
252 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  33.51 
 
 
236 aa  98.2  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  31.43 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  34.6 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  31.47 
 
 
279 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  34.16 
 
 
306 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  33.15 
 
 
252 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  32.21 
 
 
461 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  35.1 
 
 
389 aa  94.7  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  34.54 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  29.41 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  33.8 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  34.07 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  30.96 
 
 
272 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  31.42 
 
 
250 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  35.57 
 
 
231 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  32.54 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  30.69 
 
 
222 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  34.42 
 
 
236 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  34.42 
 
 
236 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  33.77 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  34.42 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  33.54 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  33.99 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  29.71 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  35.56 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  37.61 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  28.66 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  36.7 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>