25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1474 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  722    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  33.05 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  30.87 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  29.35 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  31.15 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  30.25 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  31.82 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  31.79 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  32.52 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  30.51 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  30.79 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  32.22 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  29.64 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  32.09 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  35.22 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  28.61 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  36.11 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  40.5 
 
 		 1006 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  40.24 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  32.02 
 
 		 758 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  36.91 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  37.01 
 
 		 735 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  38.14 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  27.1 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>