40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0653 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  55.5 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  54.34 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  54.73 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  54.99 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  53.37 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  53.4 
 
 		 397 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  53.14 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  53.4 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  53.14 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  52.82 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  52.63 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  53.4 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  52.22 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  51.7 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  29.34 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  28.39 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 380 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  28.28 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  28.67 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  26.77 
 
 		 278 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 718 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 808 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 595 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  24.53 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 544 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.88 
 
 		 587 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 767 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 3301 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 847 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>