28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0179 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  51.42 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  45.82 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  48.21 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  48.18 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  45.82 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  45.82 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  45.82 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  45.82 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  44.58 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  44.62 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  44.62 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  43.82 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  44.22 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  47.37 
 
 		 252 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  46.83 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  29.96 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  29.64 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  28.28 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  26.83 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  25.4 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  23.62 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  26.14 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  26.14 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  27.62 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  33.75 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  22.75 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  23.51 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>