32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2117 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  408  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  66.16 
 
 		 199 aa  278  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  56.65 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  56 
 
 		 241 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  52.24 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  52.5 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  29.73 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 597 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0738  hypothetical protein  27.75 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00463376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  32.32 
 
 		 467 aa  55.1  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  23.3 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  26.43 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  25.97 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.71 
 
 		 936 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2911  hypothetical protein  25.45 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.603232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 480 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 503 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  35.14 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1253  hypothetical protein  24.83 
 
 		 593 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177752  unclonable  0.0000127054 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0873  hypothetical protein  26.64 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  26 
 
 		 467 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1883  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 457 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1770  hypothetical protein  29.91 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.679199  normal  0.0353666 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1296  hypothetical protein  25.96 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2170  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2232  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  30.3 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 573 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 596 aa  41.6  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30539  predicted protein  24.32 
 
 		 259 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0319771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3142  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 504 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>