More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1123 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 482 aa  954    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  43.5 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  45.39 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  41.69 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  45.83 
 
 		 363 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.4 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  51.11 
 
 		 510 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 346 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  43.33 
 
 		 346 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  45.38 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  44.9 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  45.6 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  47.15 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  44.49 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 430 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  49.8 
 
 		 430 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  43.64 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  43.31 
 
 		 353 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  39.21 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 415 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  39.8 
 
 		 451 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  40.31 
 
 		 346 aa  192  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 450 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  32.29 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  37.07 
 
 		 434 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  44.16 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  39.88 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  41.05 
 
 		 407 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  39.09 
 
 		 587 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  38.56 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  37.57 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  37.57 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 476 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  40.57 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  39.09 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40.57 
 
 		 587 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40.57 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  39.09 
 
 		 587 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  40.57 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  35.53 
 
 		 438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  39.51 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1717  phosphate regulon sensor protein  44.54 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0057387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  39.51 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 585 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  44.12 
 
 		 252 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 459 aa  183  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 451 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  31.09 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  31.09 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  31.09 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  33.73 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  31.09 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  31.09 
 
 		 431 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 402 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 431 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 600 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  36.56 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  38.26 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  36.49 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  37.45 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 585 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 584 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  40.16 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  31.91 
 
 		 436 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 584 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 432 aa  176  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 432 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  37.24 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  37.24 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  37.24 
 
 		 448 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  37.24 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.24 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.24 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>