More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1118 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 463 aa  942    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  61.05 
 
 		 459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  51.2 
 
 		 455 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  50.98 
 
 		 455 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  50.98 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  50.99 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  48.36 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  50.33 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  48.49 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  48.58 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  49.01 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  49.01 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  49.45 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  50.11 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  49.89 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  42.98 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  42.54 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  42.32 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  43.93 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  43.49 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  43.49 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  41.65 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  41.65 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  42.09 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  41.87 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  41.87 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  41.65 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  42.54 
 
 		 458 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  43.17 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  41.43 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  41.65 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  41 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  40.78 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  40.22 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  40.56 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  40.56 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  44.85 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  40.09 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  36.98 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  42.89 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  40.5 
 
 		 451 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  45.12 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  38.9 
 
 		 444 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  40.68 
 
 		 466 aa  322  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  38.07 
 
 		 472 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  39.39 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  36.04 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  35.9 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  35.9 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  35.9 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  35.68 
 
 		 472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  35.68 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  35.68 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  35.68 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  35.68 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  35.46 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  39.96 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  39.96 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  39.73 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  40.18 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  35.98 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  37.03 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  37.24 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  39.06 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  38.73 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  33.85 
 
 		 465 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  35.78 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  36.55 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  34.54 
 
 		 452 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  34.39 
 
 		 452 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  34.39 
 
 		 452 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.31 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.31 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  34.39 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.96 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.96 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.96 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  34.54 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  34.54 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1121  glutamate--ammonia ligase  35.54 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  34.54 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  34.47 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  33.86 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  34.05 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  33.99 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  33.71 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  33.63 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  34.09 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  33.63 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  35.5 
 
 		 445 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  35.5 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  34.39 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  34.31 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  34.39 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  35.83 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35.27 
 
 		 445 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  34.98 
 
 		 476 aa  249  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  35.83 
 
 		 444 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  35.83 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.03 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>