29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1059 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  27.34 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  26.98 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  25.87 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  30.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  31.4 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  32.73 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  27.43 
 
 		 272 aa  51.6  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  29.17 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  30.69 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  30.61 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  27.19 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  27.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  25.69 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  27.84 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  26.26 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  29.63 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  26.36 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  28.32 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  28.7 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  30.95 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  30.77 
 
 		 276 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  28.33 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  34.52 
 
 		 139 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  26 
 
 		 233 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  27.59 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  27.5 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  21.82 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>