More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0739 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  53.77 
 
 
213 aa  216  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1904  phosphoglycerate mutase  46.5 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  41.63 
 
 
219 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  36.27 
 
 
217 aa  136  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.84 
 
 
442 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.22 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.7 
 
 
442 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.44 
 
 
442 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.23 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  33.71 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  33.71 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  29.8 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  32.88 
 
 
236 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.05 
 
 
442 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.61 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.84 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.45 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.64 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.27 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  31.44 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  28.63 
 
 
253 aa  72  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  29.07 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.75 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  35.78 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  30.53 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34127  putative phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.375403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.47 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.4 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  31.4 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  38.3 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  31.4 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  31.58 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  31.4 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  31.4 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>