More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3378 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3299  tyramine oxidase  99.31 
 
 		 433 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.510135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3304  tyramine oxidase  99.54 
 
 		 433 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3378  tyramine oxidase  100 
 
 		 433 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3473  tyramine oxidase  99.77 
 
 		 433 aa  891    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0613  FAD dependent oxidoreductase  70.6 
 
 		 454 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3371  tyramine oxidase  99.77 
 
 		 433 aa  891    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374067  normal  0.779493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3508  FAD dependent oxidoreductase  65.65 
 
 		 432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.300203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34680  putative oxidoreductase  65.42 
 
 		 432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13731  normal  0.0636806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2943  putative oxidoreductase  65.19 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 437 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  40.88 
 
 		 437 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  41.43 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  40.76 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  42.79 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  41.06 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  40.77 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 435 aa  309  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  38.85 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 430 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  41.79 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  38.85 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 		 440 aa  285  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 427 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 427 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  36.25 
 
 		 427 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  36.01 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  36.25 
 
 		 427 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  36.17 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.17 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.17 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.17 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  36.17 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  35.92 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.17 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 428 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 427 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 428 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  35.77 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 427 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  34.79 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 427 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  38 
 
 		 429 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.47 
 
 		 430 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  36 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 429 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 429 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  33.83 
 
 		 427 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 435 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>