More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1918 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  100 
 
 
372 aa  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2397  amidohydrolase  68.68 
 
 
373 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2354  amidohydrolase  68.68 
 
 
373 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  48.63 
 
 
386 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  48.08 
 
 
385 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  48.63 
 
 
385 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  47.53 
 
 
385 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  44.2 
 
 
373 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  45.5 
 
 
386 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  44.93 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  43.01 
 
 
398 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  44.66 
 
 
387 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  43.75 
 
 
381 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.44 
 
 
381 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  43.72 
 
 
381 aa  318  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  43.75 
 
 
381 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  44.29 
 
 
388 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  42.78 
 
 
381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.16 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  42.9 
 
 
381 aa  308  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.9 
 
 
381 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  44.31 
 
 
343 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0113  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.19 
 
 
388 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.46 
 
 
396 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.95 
 
 
403 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.62 
 
 
405 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.95 
 
 
403 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  40 
 
 
380 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  37.78 
 
 
395 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  38.1 
 
 
396 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.27 
 
 
387 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37.83 
 
 
396 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.7 
 
 
405 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.67 
 
 
405 aa  245  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  38.36 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  37.18 
 
 
400 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  37.29 
 
 
403 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.68 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  36.77 
 
 
397 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  37.97 
 
 
389 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  36.29 
 
 
396 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  38.24 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  37.97 
 
 
389 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  35.94 
 
 
408 aa  238  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  37.7 
 
 
389 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  37.7 
 
 
389 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  35.96 
 
 
398 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  35.71 
 
 
397 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  35.96 
 
 
398 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.7 
 
 
389 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  36.69 
 
 
392 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  37.7 
 
 
389 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  37.7 
 
 
389 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  36.55 
 
 
394 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.97 
 
 
389 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  37.5 
 
 
397 aa  236  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  35.03 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  35.03 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  35.92 
 
 
394 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.6 
 
 
400 aa  236  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  36.51 
 
 
398 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  35.83 
 
 
394 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  35.57 
 
 
395 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  34.67 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.9 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  36.24 
 
 
399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  36.63 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  36.34 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  36.46 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  36.87 
 
 
397 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  35.71 
 
 
397 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  38.24 
 
 
390 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  35.48 
 
 
384 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  35.98 
 
 
423 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  33.86 
 
 
396 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.7 
 
 
391 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.7 
 
 
391 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0220  amidohydrolase  35.56 
 
 
389 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1157  peptidase, M20/M25/M40 family  34.32 
 
 
376 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  33.86 
 
 
399 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1689  amidohydrolase  35.64 
 
 
385 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.44 
 
 
391 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  33.77 
 
 
396 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  37.53 
 
 
389 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  37.14 
 
 
397 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  35.71 
 
 
394 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  35.73 
 
 
399 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.56 
 
 
394 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  35.79 
 
 
410 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  36.17 
 
 
391 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4083  peptidase, M20/M25/M40 family  34.32 
 
 
376 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  35.15 
 
 
387 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  34.04 
 
 
415 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  34.04 
 
 
415 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  34.6 
 
 
412 aa  229  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  35.75 
 
 
389 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  35.12 
 
 
379 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.75 
 
 
404 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  37.4 
 
 
388 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  36.17 
 
 
391 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>