More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2055 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2055  sensor histidine kinase  100 
 
 
462 aa  945    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1409  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30 
 
 
496 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  23.74 
 
 
443 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
571 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.8 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  33.77 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  31.36 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
614 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  31.6 
 
 
443 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.4 
 
 
508 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  23.97 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  23.97 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
453 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  32.34 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1659  histidine kinase  33.33 
 
 
594 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
484 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  25.75 
 
 
491 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
476 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
484 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  29.46 
 
 
480 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  28.99 
 
 
482 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  28.99 
 
 
482 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  28.99 
 
 
482 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  28.99 
 
 
482 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
513 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
468 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  31.42 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  27.73 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  33.48 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
596 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  29.04 
 
 
475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  31.53 
 
 
416 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  33.92 
 
 
446 aa  111  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  27.37 
 
 
391 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  30 
 
 
496 aa  110  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
445 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  30 
 
 
484 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
517 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
532 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
532 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
484 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04720  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
331 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0135462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
450 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  31.08 
 
 
416 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
609 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
611 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
608 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.88 
 
 
446 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  28.7 
 
 
482 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  32.31 
 
 
613 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  31.49 
 
 
603 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
382 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
445 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
524 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  30.91 
 
 
416 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
438 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
604 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  30.9 
 
 
589 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
473 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  31.82 
 
 
669 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
489 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
621 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
395 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
604 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  27.95 
 
 
434 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  26.78 
 
 
449 aa  107  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
332 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  30.74 
 
 
412 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
471 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
450 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  27.15 
 
 
368 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  33.18 
 
 
613 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
467 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  30.18 
 
 
416 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  32.44 
 
 
503 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  33.18 
 
 
613 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  26.27 
 
 
470 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
467 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
413 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  32.49 
 
 
603 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  28.96 
 
 
438 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.19 
 
 
463 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
582 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>