More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2443 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
267 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 
250 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  39.33 
 
 
263 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
284 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  34.08 
 
 
261 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
266 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.83 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.59 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1905  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 
265 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.08 
 
 
261 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.05 
 
 
265 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
280 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.27 
 
 
308 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  31.76 
 
 
261 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  31.76 
 
 
261 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
267 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
274 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.39 
 
 
393 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 
261 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
270 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.98 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
260 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
271 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  32.16 
 
 
260 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.16 
 
 
260 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  34.42 
 
 
294 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
264 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.55 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  30.59 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  30.59 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  30.59 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0720  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.86668  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.47 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  35.16 
 
 
397 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.75 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.7 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  32.09 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.19 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.47 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  34.25 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  35.06 
 
 
251 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  32.61 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.54 
 
 
273 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
263 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  32.67 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.32 
 
 
265 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.38 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
278 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  34.91 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.25 
 
 
264 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
292 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1122  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
259 aa  92  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 
275 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 
305 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
275 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>