34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1044 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  785    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  45.45 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  44.1 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  47.3 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  44.86 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  42.71 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  41.01 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  41.95 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  40.2 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  42.63 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  39.23 
 
 		 190 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  36.36 
 
 		 184 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  45.71 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 214 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 201 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.77 
 
 		 697 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  41.77 
 
 		 662 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.85 
 
 		 671 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  37.1 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 636 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  44.07 
 
 		 581 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  27.59 
 
 		 215 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 672 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 		 773 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  42.19 
 
 		 154 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  34.62 
 
 		 332 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  37.88 
 
 		 664 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  27.62 
 
 		 214 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2739  phosphate uptake regulator PhoU  24.6 
 
 		 221 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0103361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  41.1 
 
 		 710 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  36.92 
 
 		 159 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 		 674 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>