More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0277 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  47.76 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.32 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  45.19 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.33 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.6 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.04 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  27.98 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.64 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.76 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  36.76 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  33.75 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.93 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  37.5 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.74 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.49 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.29 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.76 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.46 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.89 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.64 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.89 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.8 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  29.1 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  30.42 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.36 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.4 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.11 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.3 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.46 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.96 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.36 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.97 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.92 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.86 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.03 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.04 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.38 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.1 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.89 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.5 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  26.91 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.39 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  35.2 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.56 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.56 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.13 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.77 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.56 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  23.75 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.49 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.72 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  29.63 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.67 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.67 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  40.74 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.58 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.54 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  35.43 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.25 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.88 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  34.81 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.69 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  31.67 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  31.67 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  31.67 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>