100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0131 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0131  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 70 aa  140  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 812 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  41.54 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  42.86 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 825 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  43.08 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  43.48 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 845 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  33.33 
 
 		 954 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 748 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  36.23 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 752 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  39.39 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  37.1 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1008  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329666  normal  0.181285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 795 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 761 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 821 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  41.67 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  30.77 
 
 		 1196 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 818 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 751 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 712 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1164  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 719 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 76 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 802 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 71 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 754 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3236  E1-E2 ATPase-associated domain-containing protein  32.84 
 
 		 344 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  31.34 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 70 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 797 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 74 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 813 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1680  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 802 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 885 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 758 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 797 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  34.29 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 824 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 837 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 762 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12930  copper chaperone  31.25 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.88 
 
 		 751 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  35.48 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  37.5 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1516  Heavy metal transport/detoxification protein  39.29 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0275841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  31.25 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 849 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 861 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>