More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0109 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0109  aminotransferase, class V  100 
 
 		 385 aa  748    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  56.49 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  52.36 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  51.57 
 
 		 388 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.97 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  51.05 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  49.87 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  55 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  49.87 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  46.05 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  49.6 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  52.99 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  55.38 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 389 aa  362  5.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  51.97 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  48.28 
 
 		 402 aa  362  8e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  50.13 
 
 		 405 aa  362  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  49.07 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  47.2 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.93 
 
 		 384 aa  358  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  49.07 
 
 		 407 aa  355  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  48.14 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  54.33 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  48.8 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  48.8 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  48.8 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  53.68 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.07 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  48.14 
 
 		 405 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  54.07 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.07 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  48.8 
 
 		 407 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  48.27 
 
 		 407 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  48.27 
 
 		 407 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  49.22 
 
 		 399 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  49.22 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.81 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  48.38 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  48.8 
 
 		 407 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  48.91 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  53.54 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  49.87 
 
 		 395 aa  348  7e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.8 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  48.7 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  47.73 
 
 		 507 aa  347  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  51.72 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  50.95 
 
 		 408 aa  345  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  48.79 
 
 		 405 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  49.47 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  50.68 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  50.14 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  50.41 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  50.41 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  49.87 
 
 		 407 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  49.73 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  50.26 
 
 		 406 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  48.28 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  49.6 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  48.93 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  49.32 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  47.17 
 
 		 493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  48.95 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  46.92 
 
 		 430 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  46.83 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  48.53 
 
 		 419 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  47.99 
 
 		 421 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  47.35 
 
 		 404 aa  338  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  46.6 
 
 		 404 aa  338  8e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  47.62 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  47.99 
 
 		 407 aa  338  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  48.53 
 
 		 419 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  50.67 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  46.13 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  50.4 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  46.83 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  47.09 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  47.09 
 
 		 404 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>