More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3662 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  50 
 
 
307 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  37.89 
 
 
301 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  39.86 
 
 
300 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  32.99 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  28.1 
 
 
309 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.03 
 
 
305 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  33.22 
 
 
341 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  32.79 
 
 
301 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  31.21 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.83 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  32.16 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.69 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.34 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  31.8 
 
 
310 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0584  hypothetical protein  29.35 
 
 
330 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 
292 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  31.8 
 
 
310 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25.86 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.43 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  33.44 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  26.39 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  28.35 
 
 
312 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.18 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.05 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 
325 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  30.82 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  30.42 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.49 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.19 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  32.53 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  28.67 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.95 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.85 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  31.48 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  23.81 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  28.76 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  28.03 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  31.15 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  29.23 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  29.23 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  29.23 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  29.23 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.82 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  29.23 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  29.23 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  32.23 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  31.3 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  33.1 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  32.35 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.78 
 
 
311 aa  79  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.74 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  27.36 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2132  transporter, EamA family  28.32 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.405337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  26.25 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  31.83 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  32.92 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  29.05 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4549  EamA family protein  27.37 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2180  transporter EamA family  27.96 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.522746  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4903  eama family protein  27.37 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.87 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  28.38 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  28.38 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4769  transporter, EamA family  27.72 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  28.04 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.28 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  25.74 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.1 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1035  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4395  EamA family protein  27.37 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.91 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  28.33 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.91 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4788  EamA family protein  28.07 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  22.89 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  23.19 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  22.03 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.29 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4385  EamA family protein  27.93 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>