More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2991 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 126 aa  256  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  99.21 
 
 		 128 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  87.3 
 
 		 126 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  64.62 
 
 		 130 aa  177  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  63.08 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  63.85 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  60.77 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  47.79 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  47.79 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  47.33 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  47.06 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  41.04 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  43.28 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  42.54 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  42.65 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  40.6 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  41.91 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.17 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.17 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.97 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.48 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  34.09 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.97 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  35.66 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.25 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.8 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.35 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.37 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  31.71 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.63 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.56 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.17 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.39 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.86 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0170  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.32 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  32.59 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  33.58 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.19 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.94 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  33.09 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.86 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.16 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  32.33 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  32.82 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  32.82 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  31.47 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  32.82 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  32.82 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  33.78 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  32.82 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.75 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.03 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.63 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.06 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.97 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  33.59 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  30.08 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  33.08 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.06 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.56 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1561  flagellar basal body rod protein FlgC  29.71 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  34.35 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.59 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  30 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>