41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4381 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  47 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  45.45 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  28.33 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  25.76 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  25.93 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  26.98 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  27.78 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  27.04 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  27.13 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  26.65 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  25.6 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  25.12 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  23.72 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  26.68 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  25.25 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  24.43 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  25 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  24.18 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  28.61 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  23.54 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  23.27 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  24.52 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  26.1 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  25.13 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  24.94 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  35.42 
 
 		 541 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  24.4 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  35.64 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  27.61 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  22.97 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  24.81 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  22.73 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  35.11 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  26.17 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  23.76 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  24.49 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  33.33 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  22.88 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  22.09 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001322  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsE  25.22 
 
 		 269 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>