58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4110 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  73.33 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  73.33 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  38.14 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  37.19 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  32.59 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  32.59 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  39.18 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  32.28 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1582  hypothetical protein  38.02 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.447037 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  31.69 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  35.4 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  47.37 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  31.3 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  34.02 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  35.05 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4930  hypothetical protein  52.38 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.527295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  25.56 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  27.13 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  27.13 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  43.1 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  30.83 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  32.76 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0709  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.668336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 		 135 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 		 135 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 		 135 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  28.45 
 
 		 131 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.5 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.5 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.5 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  28.24 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4610  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695949  normal  0.162062 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>