31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3918 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4150  cytochrome c, class I  59.74 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2807  cytochrome c  56.88 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  50 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  48.15 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  40.69 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  36.31 
 
 		 147 aa  87.8  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  37.5 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  35.76 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.21 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  37.4 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  32.71 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.77 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  29.68 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  35.04 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  35.05 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  30.61 
 
 		 115 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  31 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  31.96 
 
 		 98 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  33 
 
 		 247 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  30 
 
 		 1439 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4471  hypothetical protein  31.58 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.181787  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  26.23 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  27.83 
 
 		 484 aa  40.4  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  31 
 
 		 245 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>